病院向け勤怠管理システム おすすめ10選を徹底比較｜選び方やメリットも解説

常勤・非常勤・夜勤など複雑な雇用形態・勤務形態になっている病院・クリニックは、勤怠管理業務に負担がかかりやすい構造になっています。本記事では、病院向けおすすめ勤怠管理システムを紹介します。医療機関の勤怠管理の課題や、勤怠管理システムを導入するメリットについても解説します。

目次

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1. 病院向け勤怠管理システムおすすめ10選
2. 【比較表】おすすめの病院向け勤怠管理システム
3. 病院向け勤怠管理システムの選び方
4. トライアルでチェックできる！勤怠管理システムの攻略ガイド

病院向け勤怠管理システムおすすめ10選

【比較表】おすすめの病院向け勤怠管理システム

病院・医療機関が抱える勤怠管理の課題とは

病院や医療機関では、一般企業とは異なる特有の勤怠管理上の課題に直面しています。ここでは、それらの課題について解説していきます。

複雑なシフト体制で労働時間の把握が難しい

病院などの医療機関では、一般企業とは異なる複雑なシフト体制が組まれていることが多く、日勤・夜勤・準夜勤・当直・宿直など多様な勤務形態が混在しています。護師や医師、医療スタッフそれぞれが異なる勤務パターンで働くため、労働時間の正確な把握が非常に困難です。

勤務時間帯が日によって大きく変動するため、従来の手書き日報やタイムカードでは記録漏れや転記ミスが発生しやすく、実際の労働時間を正確に把握することが難しくなっています。

勤務形態	勤務時間帯	管理上の課題
日勤	8:00～17:00・9:00～18:00など	残業時間の把握が曖昧
準夜勤	16:30～1:00など	日をまたぐ勤務の集計ミス
夜勤	23:00〜8:00・0:00～9:00など	深夜割増の計算漏れ
当直・宿直	17:00～9:00など	仮眠時間と実労働時間の区別が困難

シフト表作成業務の負荷が大きい

医療機関におけるシフト表作成は、一般企業とは比較にならないほど複雑な業務です。特に入院設備を持つ病院では、診療報酬の施設基準を満たす人員配置と様式９の提出義務という二重の負担が、担当者に大きなプレッシャーを与えています。

看護師のシフト作成では、診療報酬の施設基準、労働基準法の遵守・医療法の規定・個別の事情（育児・介護・希望休）など、多岐にわたる要件を同時に満たさなければなりません。

2024年問題と医師の労働時間規制への対応

2024年4月に医師の時間外労働に上限規制が適用される「医師の働き方改革」が本格的にスタート。医師の健康を守り、医療の質を維持するための重要な制度改革ですが、同時に多くの医療機関にとって大きな課題となっています。

医師の働き方改革では、時間外労働の上限が原則として年960時間以内と定められました。地域医療の確保や集中的な技能向上が必要な医師には特例水準（年1,860時間）が設けられていますが、いずれにしても従来の働き方からの大幅な見直しが必要です。

水準区分	対象	時間外労働の上限
A水準	一般的な医師	年960時間以内
B水準	地域医療確保のために必要な医師	年1,860時間以内
C-1水準	集中的に技能向上を図る研修医等	年1,860時間以内
C-2水準	高度な技能を有する医師	年1,860時間以内

病院が勤怠管理システム導入で得られるメリット

病院向け勤怠管理システム導入により、労働時間の可視化、・業務負担の軽減・法令遵守の強化など・多岐にわたる効果が期待できます。ここでは、勤怠管理システムを病院が導入するメリットを解説していきます。

労働の実態を可視化して過重労働を予防

勤怠管理システムの導入により、医療スタッフの労働時間をリアルタイムで可視化できるようになります。日勤・夜勤・当直など複雑な勤務形態でも、システムが自動的に集計するため、管理者は各スタッフの正確な勤務状況を即座に把握できます。

特に重要なのが過重労働の予防機能です。システムが残業時間や連続勤務日数を自動集計し、設定した基準値を越えた場合にアラートを発信します。これにより、医師や看護師の健康を守り、医療の質を維持することができます。

またシステムによっては、指紋認証や顔認証などの生体認証機能により、不正打刻を防止して正確な労働時間データを蓄積することも可能です。手書き日報やタイムカードでは難しかった実態把握が、システムによって実現します。

シフト編成業務の効率化と時間削減

病院向け勤怠管理システムには、複雑なシフト作成を効率化する機能が搭載されています。勤務間インターバル・夜勤時間数の制限など、多岐にわたる条件を自動でチェックしながら、最適なシフト表を作成できます。

従来は手作業で数日かかっていたシフト作成が、システムを活用することで数時間に短縮されるケースも少なくありません。スタッフの希望休やスキルレベルを考慮しながら、法令遵守を確保したシフト表を効率的に作成できます。

また、急な欠勤や勤務変更が発生した際も、システム上で即座に調整が可能で関係者への通知も自動化されます。これにより、シフト管理担当者の業務負担が大幅に軽減されます。

法令遵守体制の強化と働き方改革の推進

勤怠管理システムは、医師の働き方改革や労働基準法への対応を強力にサポートします。法令で定められた基準を自動でチェックし、違反の恐れが発生した場合はアラートを発信します。これにより、労務コンプライアンスの強化が実現し、労働基準監督署の調査や診療報酬の返還請求といったリスクを回避できます。

また、正確な労働時間管理は医療スタッフの健康を守り、離職率の低下にもつながります。蓄積されたデータを分析すれば、業務の偏りや非効率な働き方を発見し、組織全体の働き方改革を推進することも可能です。

勤怠管理システムの導入費用・相場

勤怠管理システムの費用相場は、システムのタイプによって異なります。以下では、初期費用や運用費用など導入にかかる費用相場をタイプ別に紹介します。

	初期費用	運用費用
オンプレミス型	300,000円～1,500,000円程度	300,000円〜350,000万円/月
クラウド型	0～500,000円程度	200円から10,000円/月 （従業員1人あたり）

オンプレミス型の場合

オンプレミス型の初期費用は、300,000円～1,500,000円程度とかなり高額です。イチからシステムを開発しなければならないため、人件費もかかります。

運用費も月額300,000円〜350,000円程度ですが、クラウド型と違いオンプレミス型は、従業員数に関わらず運用費用は一定なため、使用する人数によっては高額とならない場合もあります。

オンプレミス型の多くは買い切りため、システム利用に関する料金はかかりません。しかし、あくまでもシステムを利用するための料金がかからないだけで、運用にはコストがかかります。費用対効果を加味しながら、導入を検討しましょう。

クラウド型の場合

クラウド型の初期費用は、0～500,000円程度です。オンプレミス型よりも安い費用で、中には初期費用をかけずに利用できるシステムもあり、予算を抑えたい企業に向いています。

しかしクラウド型は、従業員の数に応じて運用費用が決まる従量料金制のため、場合によっては費用が高額になるケースもあります。また、オンプレミス型と比較すると、カスタマイズ性の自由度も低いため、初期費用だけでなく導入費用も含めて検討しましょう。

病院向け勤怠管理システムの選び方

病院向けの勤怠管理システムを選ぶ際は、医療現場特有のニーズに対応できるかどうかが重要です。ここでは、システム選定時に確認すべき主要なポイントを解説します。

施設規模に合っている

病院の規模によって、求められる勤怠管理システムの機能は大きく異なります。自院の規模や運営体制に合ったシステムを選ぶことで、導入効果を最大化できます。

クリニック・診療所：軽量システム

無床クリニックや小規模診療所では、基本的な勤怠管理機能を備えたシンプルなシステムが適しています。タイムカードの集計自動化、有給休暇管理、残業時間の把握など、必要最小限の機能で十分なケースが多いでしょう。

夜勤や宿直がない場合は、汎用型の勤怠管理システムでも対応可能です。クラウド型システムを選べば、導入コストを抑えつつ、計算ミス防止や労務管理の効率化を実現できます。

スタッフ数が10名以下の小規模施設では、無料プランや少人数向けプランを提供しているシステムも検討する価値があります。ただ、無料プランには使用制限があったりセキュリティが脆弱だったりするシステムも存在するので、導入前に利用できる範囲やセキュリティについて把握するようにしましょう。

中小規模病院：機能バランス型

30〜200床程度の中小規模病院では、シフト作成機能と勤怠データの自動集計機能が標準搭載されたシステムが適しています。職員数が限られる一方で、夜勤や宿直を含む複雑な勤務形態があるため、効率的な管理が必要です。

特に重要なのが、勤務間インターバルや様式９作成といった法令対応機能です。これらの機能により、コンプライアンスを確保しつつ、職員の健康管理を支援できます。給与計算システムとの連携機能があれば、勤怠データを自動で取り込むことで給与計算業務の効率化も実現します。

大規模総合病院：エンタープライズ対応

200床以上の大規模病院では、24時間体制の運用を支援する高機能なシステムが必要です。多職種が連携して患者対応を行うため、シフト管理が非常に複雑化します。

大規模病院向けシステムには、以下のような機能が求められます。

• 勤務間インターバルアラート – 長時間労働の防止
• 代償休暇の自動計算 – 法令遵守の徹底
• 複数部署・多職種の一元管理 – 組織全体の勤務状況把握

大規模病院では、オンプレミス型やカスタマイズ対応のシステムを選ぶケースも多く、初期費用として数百万円〜かかる場合があります。しかし、職員数が多いほど業務効率化の効果も大きく、長期的には投資対効果が高いと言えます。

使いやすい直感的な操作性

医療現場は多忙を極めるため、誰でも直感的に操作できるシステムを選ぶことが重要です。医師や看護師、事務スタッフなど、ITリテラシーが異なる多職種が利用するため、複雑な操作が必要なシステムでは定着しません。

また、管理側が管理画面を問題なく操作できるかも重要です。管理担当者立会のもと無料トライアルを活用するなどして、導入後に「画面がわかりにくくて使えない」という事態にならないようにしましょう。

多彩な打刻手段とマルチデバイス対応

病院では、職種や勤務形態によって最適な打刻方法が異なります。ICカード・指紋認証・顔認証・Web打刻・スマホアプリ打刻など、多様な打刻方法に対応したシステムを選ぶことで、現場の状況に合わせた柔軟な運用が可能になります。

特に注目されているのが、ビーコンを活用した打刻不要の勤怠管理です。医師が院内に入るだけで自動的に出勤が記録されるため、打刻忘れの心配がありません。

既存システムとの連携・統合性

勤怠管理システムが既存で導入している業務ツールと連携できれば、データの二重入力やチェック作業の手間を大幅に削減できます。例えば給与計算システムとの連携は、勤怠データを自動で取り込むことで、計算ミスの防止と業務効率化に直結します。導入前に、現在使用している他システムとの連携実績や対応状況を必ず確認しましょう。

導入後のサポート体制

病院特有の複雑な勤務形態や就業ルールに対応するには、充実したサポート体制が不可欠です。操作方法のレクチャーだけでなく、シフトパターンの設定支援や、法令改正時の対応など、継続的なサポートが受けられるベンダーを選びましょう。

電話・メール・チャットなど、複数のサポートチャネルが用意されているか、土日の対応の有無・連絡対応時間は何時から何時までかも確認しておくと安心です。

トライアルでチェックできる！勤怠管理システムの攻略ガイド

ここでは、導入すべき勤怠管理システムなのか判断する際に踏むべきステップをご紹介します。ほとんどが無料トライアル期間中に確認できる項目です。導入後のミスマッチを防止できるので、ぜひご活用ください。

⬇️　STEP1：運用しやすさチェック

勤怠管理システムのトライアルは、ストレスなくソフトを使えるかを確認する絶好の機会です。実際に使用する担当者に業務を想定した作業をしてもらい、以下の項目をチェックするのがおすすめです。

🚩　STEP2：サポート体制チェック

トライアルのタイミングでサポート体制がどのように整備されているのか、実際に利用するとなったらどのような手順を踏む必要があるかを確認しましょう。以下の項目をチェックするのがおすすめです。

勤怠管理システムの導入で利用できる補助金・助成金

勤怠管理システムを導入する際、補助金や助成金の申請ができ、導入費用の負担を軽減させることができます。ここでは、勤怠管理システムを導入する際に使える補助金・助成金を紹介します。

デジタル化・AI導入補助金

デジタル化・AI導入補助金（旧:IT導入補助金）は、中小企業・小規模事業者の業務効率化やDX推進を支援するための補助金制度です。近年はAI活用の推進にも力が入れられており、AI機能を搭載したITツールも補助対象として活用されています。

補助金の活用により、企業は導入コストを抑えながら業務の自動化や生産性向上を進めやすくなります。なお、補助対象となるツールや補助額、申請条件は年度によって変更される場合があります。

そのため、制度を利用する際は、最新の公募要領や対象ITツールを事前に確認しましょう。

参考：デジタル化・AI導入補助金2026

働き方改革推進支援助成金

厚生労働省が定めた5つの要件を満たした中小企業事業主が対象となる助成金で、労務管理や人材確保、業務の効率化といった業務に取り組むための設備投資に対して経費助成を行うことを目的としています。

勤怠管理システムの導入で利用できるコースは次の3つです。

1. 労働時間適正管理推進コース
2. 労働時間短縮・年休促進支援コース
3. 勤務間インターバル導入コース

それぞれ助成金の支給額や補助率は変わるため、見合ったコースを選ぶことで適切な助成を受けられます。

参考：働き方改革推進支援助成金（労働時間短縮・年休促進支援コース）｜厚生労働省

まとめ

ここまで病院向け勤怠管理システムのおすすめや選び方について解説してきました。医療機関に勤怠管理システムを導入すれば、勤務状況をリアルタイムに把握でき、正確で効率的な労働時間の管理が可能になります。適切な勤怠管理システムの導入により、医療スタッフの働きやすさ向上と医療の質の維持を両立させましょう。